凡纳滨对虾SNP标记开发与家系亲缘关系验证分析

摘要：

本研究基于转录组序列开发了37个SNP标记,并对22个凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)家系进行了遗传多样性、家系聚类和亲子鉴定分析,探讨SNP标记在对虾家系选择育种中的应用途径.结果 显示,37个SNP位点在凡纳滨对虾22个家系中的平均期望杂合度(He)和平均观测杂合度(Ho)分别为0.38和0.34;平均多态信息含量(PIC)为0.30,属于中度多态性(0.25＜PIC＜0.5).对家系进行遗传距离计算和聚类分析,半同胞家系F11和F17间的遗传距离最小(0.04),最先聚在一起.亲子鉴定结果表明,在双亲性别已知情况下,亲子间的累积排除率(CPE)为99.99％,子代的实际鉴定率为77.27％.研究表明,在凡纳滨对虾性状测试和系谱追踪过程中,利用高质量的SNP标记代替物理标记来识别家系是一种准确可行的方法.

关键词：家系、SNP标记、遗传多样性、聚类分析、亲子鉴定

所属期刊栏目：42

分类号：S917(水产基础科学)

资助基金：国家重点研发计划;山东省农业良种工程;农业农村部农业国际合作交流项目-热带国家水产养殖科技创新合作和湛江市水产良种体系建设项目

在线出版日期：2020-12-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：108-116