中国对虾甘氨酸脱羧酶的基因克隆、表达及其与抗WSSV的关联分析

摘要：

本研究采用RACE技术克隆获得中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)甘氨酸脱羧酶基因(FcGLDC)的全长cDNA及DNA序列,并对其进行生物信息学分析.结果 显示,FcGLDC基因的cDNA全长为3481bp,其中,ORF为2829bp,5'UTR长17bp,3'UTR长86bp.完整的阅读框编码942个氨基酸,分子量为104.66 kDa,预测的理论等电点为6.51.FcGLDC基因DNA序列全长共4964 bp,包含12个外显子和11个内含子.同源性及系统进化分析显示,FcGLDC基因与节肢动物的GLDC基因聚为一类;氨基酸序列比对发现,FcGLDC基因的蛋白序列与节肢动物的相似度最高,与内华达白蚁(Zootermopsis nevadensis)、体虱(Pediculus humanus corporis)和白纹伊蚊(Aedes albopictus)的相似度分别为71％、68％和68％.在鳃、肝胰腺和肌肉中的荧光定量PCR结果显示,FcGLDC在肌肉中的相对表达量最高,鳃中最低.WSSV感染后,该基因在鳃、肝胰腺和肌肉中呈现出了不同的时空表达特点.使用直接测序法结合质谱法,在该基因内部发现4个SNP位点,但是各位点与抗WSSV性状均不相关(P＞0.05).本研究表明,FcGLDC基因在对虾感染WSSV后的应答反应中或起一定作用.

关键词：中国对虾、甘氨酸脱羧酶、基因克隆、表达、关联分析

所属期刊栏目：40

分类号：Q785;S966.1(基因工程（遗传工程）)

资助基金：中国水产科学研究院黄海水产研究所基本科研业务费20603022017001;国家自然科学基金41676148;泰山学者良种工程项目和现代农业产业技术体系专项资金CARS-48

在线出版日期：2019-04-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：74-82