海带hsp70基因的克隆、分析及转录水平定量研究

摘要：

本研究以海带(Saccharina japonica)‘海天1号’为材料,通过RACE-PCR方法获得海带hsp70(Sjhsp70)基因全长cDNA序列.序列分析表明,全长cDNA长度为3778 bp,含有1个2892 bp的开放阅读框,5'和3'非编码区的长度分别为101、785 bp.蛋白质氨基酸含量和理化性质分析显示,该蛋白为稳定蛋白.应用BLASTP程序对不同物种HSP70蛋白比较分析表明,海带与长囊水云(Ectocarpus siliculosus)的HSP70蛋白具有较高的同源性,用HSP70蛋白构建的进化树显示,海带与长囊水云聚为一类.二级结构预测该蛋白由963个氨基酸组成,包含35个α螺旋和25个β折叠.以酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)HSPl10蛋白三维结构3C7N为模板,在I-TASSER软件上预测海带HSP70蛋白的三维结构,预测的蛋白结构与3C7N的A链在折叠和二级结构方面非常类似.对Sj hsp70基因在温度胁迫下表达变化分析表明,高温对Sjhsp 70的表达量具有显著影响,hsp70在25℃、24h胁迫条件时,表达量达到最大值.本研究为阐明海带HSP70蛋白特性及其应对环境胁迫的机理提供理论依据.

关键词：海带’海天1号’、HSP70、RACE、生物信息学分析、荧光定量PCR

所属期刊栏目：39

分类号：Q75;S917(分子遗传学)

资助基金：中国水产科学研究院基本科研业务费专项2016PT03;现代农业产业技术体系藻类体系离岸式养殖岗位专项CARS-50;青岛市民生科技计划项目17-3-3-65-nsh

在线出版日期：2018-09-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：152-158