虾夷扇贝EST-SSR标记在栉孔扇贝中的通用性研究

摘要：

为研究虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)和栉孔扇贝(Chlamys farreri)的群体遗传多样性并分析其亲缘关系,对在虾夷扇贝中开发的60个EST-SSR位点在栉孔扇贝中的通用性进行了研究.结果显示,21个位点可在栉孔扇贝中扩增出特异性条带,通用性比例达35.00％,其中,17个位点具有多态性,多态性比例达28.33％.在虾夷扇贝和栉孔扇贝群体中,平均等位基因数(Na)分别为2.7647和2.3529;平均有效等位基因数(Ne)分别为1.9487和1.6350;平均观测杂合度(Ho)为0.6314和0.3333;平均期望杂合度(He)为0.4569和0.3139;平均多态信息含量(PIC)为0.3726和0.2597;Nei's (1973)基因多样性指数(I)分别为0.4493和0.3087;Shannon信息指数分别为0.7176和0.5041;固定指数(Fis)检测发现,7个位点偏离了Hardy-Weinberg平衡;遗传分化系数(Fst)为0.2398.本研究开发的21对通用性EST-SSR标记,为进一步开展虾夷扇贝和栉孔扇贝遗传多样性分析、分子辅助育种、基因发掘和种质资源评价奠定了基础.

关键词：虾夷扇贝、栉孔扇贝、EST-SSRs、微卫星、多态性、通用性

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分类号：S968.31(水产养殖技术)

资助基金：国家自然科学基金31602153;青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室开放基金2016LMFS-B02;海水养殖教育部重点实验室开放基金KLM2018004;山东省自然科学基金ZR2016CQ32

在线出版日期：2018-09-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：139-146