10种软骨鱼线粒体基因组特征分析

摘要：

综合分析了软骨鱼10个物种的线粒体基因组全序列,全面揭示软骨鱼线粒体基因组的基本特征、蛋白质编码基因和差异位点等.软骨鱼10个物种线粒体基因组均编码后生动物标准的37个基因,而且其基因排列完全相同.真鲨目和鳐形目线粒体基因组的13个蛋白质编码基因的Ka/Ks比值都远远低于1(0.019 1～0.156 4),显示出较强的纯化(负)选择.基于线粒体基因组构建的系统发育树结果显示,软骨鱼纲分为两支:全头亚纲和板鳃亚纲.在板鳃亚纲内部,鳐形目和鲼形目聚为一支;真鲨目、鼠鲨目、须鲨目、虎鲨目和角鲨目聚为一支,其亲缘关系为:{[(真鲨目+鼠鲨目)+须鲨目)]+虎鲨目}+角鲨目.软骨鱼线粒体基因组差异位点分析表明,在软骨鱼群体遗传的研究中,had5和nad4基因是理想的分子标记,可以作为coxl基因辅助的分子标记,用于分析软骨鱼不同群体之间的遗传多样性,为其生物多样性的保护及合理利用其生物资源提供更多保障.

关键词：软骨鱼纲、线粒体基因组、系统发育、差异位点、分子标记

所属期刊栏目：32

分类号：Q595.4

资助基金：国家自然科学基金40906067;江苏省"青蓝工程"人才基金苏教师[2010]27号;江苏省自然科学基金BK2007066;江苏省海洋生物技术重点建设实验室研究基金2009HS13;淮海工学院自然科学基金Z2009048

在线出版日期：2011-11-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：26-32