常规PCR、实时定量PCR检测传染性皮下及造血器官坏死病毒的效果分析

摘要：

对虾传染性皮下及造血器官坏死病毒(IHHNV)可感染世界各地养殖对虾,给对虾养殖业造成严重经济损失.本实验首次采用实时定量PCR法对广西地区的84份凡纳滨对虾样品进行检测,同时以常规PCR检测作对照.实时定量PCR检测阳性率为79.8%,常规PCR检测阳性率为40.5%,表明广西地区养殖的凡纳滨对虾IHHNV的感染率较高.将二者检测均呈阳性的30份样品扩增产物进行序列分析测序,测序结果通过DNA STAR软件包进行分析,并通过NCBI Blast与GenBank中的序列进行比对.结果证明,测定的是IHHNV序列.30份样品的IHHNV序列很保守,可以分为4种类型,仅有两个碱基的位置发生变异.实时定量PCR检测IHHNV,快速、灵敏、准确,特异性好,可以作为检测对虾感染病毒的有效方法.

关键词：凡纳滨对虾、传染性皮下及造血器官坏死病毒(IHHNV)、实时定量PCR、常规PCR、测序

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分类号：S945.4(水产保护学)

资助基金：国家质量监督检验检疫总局资助项目2006IK003;山东省出入境检验检疫局科研项目SK200686

在线出版日期：2008-06-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：90-96