DBAT酶的同源建模及与多样性底物对接

摘要：

10-去乙酰巴卡亭Ⅲ乙酰基转移酶(DBAT)是紫杉醇生物合成途径中催化10-去乙酰巴卡亭Ⅲ生成巴卡亭Ⅲ的一个关键酶,由于其催化效率低,使得天然巴卡亭Ⅲ和紫杉醇含量都很低,紫杉醇细胞工厂的构建也受到严重制约.本研究利用MODELLER同源建模软件,构建了未报道晶体结构的DBAT三维结构模型,结合分子动力学模拟DBAT在稳定状态前后氨基酸的位置变化,分析关键氨基酸改变对酶催化活性的影响,获得位点His162和Arg365.利用虚拟定点突变和分子对接技术,推断His162为关键活性氨基酸残基,Arg365的空间位阻效应可影响催化反应过程.本研究为后续DBAT催化机理的解析提供潜在靶点,并为DBAT分子设计奠定基础.

关键词：紫杉醇、巴卡亭Ⅲ、DBAT、同源建模、分子对接、活性口袋

所属期刊栏目：30

分类号：O643.1(物理化学（理论化学）、化学物理学)

资助基金：广东省科技计划项目2014B050505018,2015A020209121;广州市科技计划项目201607010197;国家自然科学基金项目31071837

在线出版日期：2018-09-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1246-1251