计算机模拟 HsRAD51蛋白与多肽 BRC4分子对接

摘要：

研究使用 ZDOCK 算法进行 HsRAD51蛋白与多肽 BRC4分子对接的准确性．采用 Accelrys Discovery Studio 3．5软件计算平台，使用基于快速傅立叶转换的 ZDOCK 分子对接程序进行蛋白 HsRAD51与乳腺易感基因 BRCA2的重复基元 BRC4的分子对接，然后使用 RDOCK 程序进行结果优化，最后将通过分子对接得到的几个蛋白‐多肽复合物的三级结构与文献报道的通过 X 射线测得的蛋白 HsRAD51与 BRC4复合物的准确结构进行叠合比较，结果发现其中一些结构的叠合效果较好，碳链骨架叠合的 RMSD 最小的为0．0344 nm ．推测使用 ZDOCK 分子对接程序来进行 HsRAD51蛋白与多肽的对接，具有较高的准确性．该结果为今后研究HsRAD51蛋白与 BRCA2其他重复基元的分子对接以及相互作用提供了重要依据．

关键词：HsRAD51、BRC4、BRCA2、ZDOCK、分子对接

分类号：O629.7(有机化学)

资助基金：国家自然科学基金21172054，21572046，21301050．

在线出版日期：2016-03-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：97-101