具核梭杆菌具核亚种蛋白质组及其在癌症pH环境下的差异蛋白质组分析

摘要：

利用LC-MS/MS对F.nucleatum的蛋白质表达谱进行了深入研究,共鉴定到1198个蛋白质的表达,占基因组58％的编码基因.通过在pH 6.5(癌症组织pH环境)和pH 7.5(正常组织pH环境)两种条件下F.nucleatum蛋白质表达的定量蛋白质组学分析,发现处于癌症微环境pH条件下蛋白质表达的变化明显集中于金属离子转运,硫胺素代谢,糖代谢等过程和功能.产丁酸发酵的能量代谢通路中的七个代谢酶在蛋白质组数据中找到,其中有五个在癌症pH条件下显著下调,这五个酶包含了丁酸盐代谢的整个过程,这为结直肠癌患者肠道丁酸盐含量降低提供了新的证明.此外,癌症pH条件下F.nucleatum的丁酸代谢受到抑制,造成产丁酸能力下降,可能是其促进结直肠癌发展在代谢水平上的原因之一.

关键词：具核梭杆菌、蛋白质组、非标定量、pH环境、丁酸代谢

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资助基金：Project supported by MOST 863 Program No.2012AA020201 and CERS-1-66 CERS-China Equipment and Education Resources System and Research Fund for the Doctoral Program of Higher Education of China No.20130071140007.项目受863计划No.2012AA020201,国家“211工程”项目高等学校仪器设备和优质资源共享系统cers-1-66,高等学校博士学科点专项科研基金No.20130071140007资助.

在线出版日期：2015-05-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：337-342