VEGFR-2与抑制剂Sunitinib的分子对接及分子动力学研究
用分子对接方法研究了VEGFR-2和抑制剂Sunitinib的相互作用模式,并对其复合物进行了10 ns的分子动力学(Molecular Dynamics,MD)模拟.结果表明,抑制剂Sunitinib能与VEGFR-2中位于活性空腔的Glu885,Ile888,His1026,Asp1028,Asp1046五个氨基酸残基形成疏水作用;另外,VEGFR-2中His1026,Cys1024,Asp1046三个氨基酸残基能与Sunitinib形成三个作用强度不同的氢键.这些基团之间的相互作用是Sunitinib抑制VEGFR-2活性的关键因素.研究结果可为VEGFR-2抑制剂的结构改良、分子设计、合成提供理论参考,并有助于寻找活性更高、效果更好的抗肿瘤药物.
VEGFR-2、Sunitinib、分子对接、分子动力学
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TD923.14(选矿)
国家自然科学基金30972240;辽宁省教育厅科技研究No.2008T023资助项目~~
2012-07-20(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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