基于氨基酸描述符SVHEHS的ACE抑制肽QSAR研究
收集20种天然氨基酸的457种理化性质,按照疏水、电性特征、氢键贡献和立体特征分类后,对它们分别进行主成分分析(Principal component analysis,PCA),得到一个新的氨基酸残基结构描述符SVHEHS.用该描述符分别对血管紧张素转化酶(Angiotensin Ⅰ converting enzyme,ACE)抑制二肽、三肽、四肽进行序列表征,并用来与生物活性建立偏最小二乘(Partial least square regression,PLS)模型.ACE抑制二肽、三肽、四肽模型的相关系数、交叉验证相关系数、均方根误差、外部验证相关系数分别为0.607,0.507,0.587,0.783;0.852,0.813,0.232,0.839;1,1,0,0.935.由此说明,采用SVHEHS描述符建立的PLS模型拟合、预测能力均较好,可用于血管紧张素转化酶抑制肽的定量构效关系研究.
氨基酸描述符、血管紧张素转化酶抑制肽、偏最小二乘、定量构效关系
70
O621.2(有机化学)
国家自然科学基金31101348;上海市晨光计划项目2008CG55;2009CG50;江南大学食品科学与技术国家重点实验室开放课题资助课题SKLF-KF-201106
2012-04-28(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
83-91