化合物结构特征与其基因表达信息的互补性研究

摘要：

化合物分子指纹在化合物相似性比较、生物芯片技术在分子标记识别中都有着重要的应用,因而受到广泛的重视.但是由于这两个研究对象依传统的观点,分属于化学信息学和生物信息学两个不同的研究领域,因此一直未能在同一研究对象中同时得到应用.近年来,小分子刺激的生物芯片数据的大量出现,使得联合化合物的结构特征及其基因表达谱信息共同的用于药物筛选成为可能.为此,根据本质和外延互补的哲学思想,提出了综合运用这两种数据来共同描述化合物的新方法.通过(1)只利用化合物分子指纹,(2)只利用化合物基因表达谱信息和(3)前面两种方法互补等三种方法在化合物相似性比较的研究中,发现本文提出的互补方法比前两种方法的查询结果更准确:(1)使结构和功能两方面均相似的化合物之间的相似性更高,(2)并且能有效使那些仅在某一方面表现非常特殊的化合物能够暴露出来,而得到有效地排除.本研究给化学信息者和生物信息者莺新审视以往的数据,联合致力于药物的筛选提供了线索.化合物分子指纹(本质)和基因表达谱(外延)的互补原理则为药物的筛选提供更有效的依据,并最终加快药物的研发进程.

关键词：分子指纹、基因表达、小分子芯片、药物筛选、互补原理

所属期刊栏目：68

分类号：O6(化学)

资助基金：同济大学青年优秀人才培养行动计划2008KJ073;国家自然科学基金30976611;科技部重大科技专项2009ZX10004-601

在线出版日期：2011-03-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：2395-2400