4-巯乙基吡啶配基与IgG相互作用的分子模拟研究

摘要：

4-巯乙基吡啶(MEP)是一种新型的疏水性电荷诱导层析(HCIC)配基,具有良好的抗体分离性能,采用分子模拟方法研究MEP配基与IgG间的分子相互作用,以探讨HCIC分离机制.先通过分子对接搜索IgG分子Fc片段A链的蛋白表面,确定12个可能与MEP结合的位点区域,然后用分子动力学模拟考察了其中6个位点的结合性能.结果表明,MEP在Fc-A链表面的结合具有疏水倾向性,pH中性条件下,MEP能稳定地结合在TYR319和LEU309附近的位点,并与两者形成氢键作用,该区域具有疏水性极强的口袋结构;其他位点的结合较不稳定,受MEP取向影响大.在pH4.0酸性条件下,原先稳定结合的MEP快速从Fc-A链表面脱离,主要原因是MEP和Fc间的静电排斥作用,以及疏水作用减弱和氢键结合的消失.通过分子模拟方法,从分子水平验证了HCIC独特的作用机理:疏水相互作用主导吸附,静电排斥作用协助解吸.

关键词：4-巯乙基吡啶、IgG、疏水性电荷诱导层析、结合模式、分子模拟

所属期刊栏目：68

分类号：O6(化学)

资助基金：国家自然科学基金20776129;20976154;新世纪优秀人才支持计划、绿色化学合成技术国家重点实验室培育基地开放研究基金资助项目

在线出版日期：2010-11-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1597-1602