基于"底物包膜"假说筛选新型HIV-1蛋白酶抑制剂

摘要：

基于"底物包膜"假说,以现有HIV-1蛋白酶抑制剂Darunavir为模板构建药效团模型并对中药化学数据库进行搜索;采用分子对接方法进一步考察化合物与HIV-1蛋白酶结合情况及其与"底物包膜"符合程度,优先选出两个化合物Annomonicin和去乙酰蟾蜍它灵;应用分子动力学方法对这两个化合物进行动力学模拟,观察它们与蛋白酶结合的复合物在动力学过程中的稳定性并计算其结合自由能,综合评价筛选结果,最终确定化合物Annomonicin具有更潜在的深入研究价值.

关键词："底物包膜"假说、药效团、分子对接、分子动力学模拟、HIV-1蛋白酶抑制剂

所属期刊栏目：67

分类号：O6(化学)

资助基金：国家自然科学基金30472166;天津市科技攻关计划重点科技攻关专项基金06YFGZSH07000

在线出版日期：2009-09-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1098-1102