应用MM/PBSA方法研究CDK2活性口袋内溶剂水分子对CDK2-配体结合自由能的影响

摘要：

应用MM/PBSA方法研究了CDK2活性口袋内溶剂水分子对CDK2-配体结合自由能的影响.结果表明,活性口袋内溶剂水分子对CDK2-配体相互作用自由能有一定的贡献,其贡献的大小随配体不同而有所差异,导致这种差异的主要原因是活性位点内溶剂水分子与蛋白残基和配体之间形成了不同的氢键相互作用网络.

关键词：MM/PBSA、CDK2、结合自由能、溶剂水分子、分子动力学

所属期刊栏目：67

分类号：O6(化学)

资助基金：国家自然科学基金30772651;四川省青年基金08ZQ026-030

在线出版日期：2009-04-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：255-260