酮醇酸还原异构酶(KARI)与其抑制剂间相互作用的分子模拟研究

摘要：

采用MCCE,Autodock及密度泛函方法对酮醇酸还原异构酶(KARI)与其抑制剂间相互作用进行了研究.计算结果表明,KARI活性位点中的Mg2+在活性位点残基的离子化状态、活性位点的静电性质以及与抑制剂结合等方面起重要的作用;同时,抑制剂在结合方式、前线轨道布居及静电势等方面与酶促反应中间体(HOIV)具有一定程度的相似性;可电离的羧基是当前发现的靶向KARI抑制剂一个重要的结构特征,进一步推广可认为潜在的抑制剂应该拥有可电离成负电荷的功能团.在药物设计中考虑到以上结论,将有利于发现和改造靶向KARI的抑制剂.

关键词：酮醇酸还原异构酶(KARI)、抑制剂、Possion-Boltzmann方程、分子对接、密度泛函理论

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分类号：O6(化学)

资助基金：国家重点基础研究发展计划973计划2003CB114406;国家自然科学基金20432010;天津市科委高性能计算项目043185111-5

在线出版日期：2007-10-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1693-1701