基于GROMACS软件的本科生酶工程创新实验项目设计——微生物谷氨酰胺转胺酶在水溶液中的分子动力学模拟

摘要：

基于分子动力学模拟软件GROMACS设计了微生物谷氨酰胺转胺酶在不同温度水环境下的分子动力学模拟实验,通过计算模拟过程中酶蛋白主链动力学,分子内氢键数目,回转半径以及溶剂可接触表面积的变化,分析温度对酶的结构与功能造成的影响.该模拟实验可帮助学生:(1)掌握蛋白质分子在水溶液中动力学模拟的方法;(2)理解温度对酶结构稳定性和活性造成的影响;(3)了解分子运动特性的生物学的意义;(4)学习酶工程研究的新手段.

关键词：微生物谷氨酰胺转胺酶;分子动力学模拟;主链动力学;热变性;GROMACS

所属期刊栏目：42

资助基金：国家自然科学基金;郑州轻工业大学博士科研启动基金

在线出版日期：2021-11-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：102-107