草地贪夜蛾RACK1基因生物信息学及表达分析

摘要：

蛋白激酶C受体l(Receptor for Activated C Kinase 1,RACKl)是WD40家族的成员,其作为稳定蛋白激酶C(Protein Kinases C,PKC)的受体,参与了多种生理活动.课题组前期从转录组数据中筛选获得了草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda)的RACK1序列,该研究通过生物信息软件对SfRACK1进行生物信息学分析,并以氨基酸序列为基础与其他昆虫的RACK1进行同源性比较;同时分析RACK1在草地贪夜蛾不同发育阶段不同组织以及NPV刺激后不同时间段的表达模式,探究草地贪夜蛾RACK1的功能以及该基因是否应答NPV刺激.结果表明:草地贪夜蛾RACK1的ORF序列长度为960 bp,可编码319个氨基酸,包含有7个重复的WD40结构域,预测其分子量和等电点分别为35.9 kDa和8.07,未发现信号肽和跨膜结构;多重序列比对及进化树分析表明,SfRACK1与棉铃虫、小菜蛾等鳞翅目昆虫亲缘关系较近;组织表达及时空表达结果表明,SfRACK1基因在脂肪体及成虫期具有较高的表达水平,而在表皮和卵中的表达量较低;当草地贪夜蛾受到NPV侵染后,其SfRACK1基因在中肠的相对表达水平显著高于对照组.以上研究结果表明,SfRACK1基因在草地贪夜蛾正常生长发育过程中发挥了重要作用,而该基因可以响应NPV的侵染.

关键词：蛋白激酶C受体l、草地贪夜蛾、核型多角体病毒、生物信息学、表达分析

分类号：Q751;S433.4(分子遗传学)

资助基金：湖南人文科技学院大学生创新创业训练计划;湖南省自然科学青年基金项目;湖南省教育厅科学研究重点项目

在线出版日期：2023-03-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1-8