广益黑猪繁殖性状的全基因组关联分析

摘要：

选取441头广益黑猪经产母猪为研究对象,利用猪 50K SNP芯片对猪耳组织DNA进行基因型分型,PLINK 1.9质控后,采用GMAT中的重复力模型进行猪繁殖性状相关的全基因组关联分析,确定显著位点.结果表明:441头经产广益黑猪母猪的耳组织DNA基因分型共获得 50898 个SNPs,经质控剩余 46165 个SNPs位点用于关联分析;平均亲缘关系系数为-0.0022,平均亲缘关系较远,不存在明显的群体分层;总产仔数性状有 1个 SNP 在全基因组范围内达到显著相关,4 个 SNPs 达到潜在显著关联,候选基因包括 PIK3C3、ENSSSCG00000003753、MAP3K3、DCAF7;产活仔数性状有 6个SNPs潜在显著关联,候选基因包括ZNF585A、ENSSSCG00000022411、ZNF784、ENSSSCG00000029007、PigE-108A11.5、PigE-108A11.3、ENSSSCG00000023343;弱仔性状有1个SNP达潜在显著关联,候选基因包括KRTAP7-1和TIAM1;经基因功能分析推测,PIK3C3、MAP3K3可能是影响猪总产仔数的候选基因.

关键词：广益黑猪、繁殖性状、全基因组关联分析、SNP、候选基因

所属期刊栏目：49

分类号：S828.2(家畜)

资助基金：湖南省自然科学基金项目;湖南省重点研发计划项目;湖南省重点研发计划项目;湖南省重点研发计划项目;湖南省重点实验室开放研究基金项目

在线出版日期：2023-09-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：453-460