10.13331/j.cnki.jhau.2023.04.008
铁氧化菌菌株EEELCW01的基因组分析及砷转化功能
以从砷污染农田土壤中分离的 1 株铁氧化细菌EEELCW01 为研究对象,对该菌进行全基因组分析,通过GO、KEGG、COG等数据库比对,预测该菌砷相关基因的功能;采用水培试验,验证该菌的砷转化能力.结果表明:菌株EEELCW01 基因组大小为 4714242 bp,具有 2条大小分别为 2065078 bp和 2649164 bp的染色体,GC含量为 55.99%,染色体上有 4588 个CDS,包含 58 个tRNA和 12 个rRNA;COG数据库注释表明该菌基因功能主要集中在氨基酸转运代谢、无机离子转运代谢等过程,GO数据库注释表明该菌主要包含膜组成部分、氧化还原过程和相关酶活性等功能,KEGG注释显示代谢相关的基因占比最高;菌株 EEELCW01 基因组中含有多种与砷代谢相关的基因(arsC、arsH、arsB、arsR、acr3、arrA、arxA和arsM);菌株EEELCW01将As(Ⅴ)还原为As(Ⅲ)的能力强,有氧条件下,3 d时还原率达 40.1%.可见,可利用该菌株促进砷的生物还原,并联合砷超富集植物进行环境砷污染修复.
砷、铁氧化菌、砷转化、基因组分析、功能注释
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X172(环境生物学)
国家自然科学基金42177392
2023-09-14(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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