短短芽孢杆菌TetR基因家族的鉴定及表达模式分析

摘要：

采用生物信息学方法从生防菌短短芽孢杆菌(Brevibacillus brevis)X23全基因组水平鉴定出13个TetR家族基因,将其命名为BbTetR1、…、BbTetR13,对其基本性质、基因结构和高级结构进行分析.结果表明:短短芽孢杆菌TetR家族成员在进化上具有保守性,基因序列长度为477～681 bp,编码的蛋白由168～226个氨基酸组成,相对分子质量为1.9×104～2.57×104,等电点为4.84～7.77;其基因家族成员可划分为3个亚族,亚族Ⅰ包含5个成员,亚族Ⅱ、亚族Ⅲ各包含4个成员;所有BbTetR蛋白均含有大量α–螺旋,且这些蛋白的空间结构呈现多样化;转录组分析结果表明,不同的BbTetR在短短芽孢杆菌不同生长时期的表达模式和表达量差异显著,BbTetR1、BbTetR5、BbTetR8和BbTetR10在短短芽孢杆菌不同生长阶段均有较高表达,推测其可能发挥更重要的调控作用.

关键词：短短芽孢杆菌、TetR基因家族、生物信息学、表达模式

所属期刊栏目：48

分类号：Q936;Q78(微生物学)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;国家自然科学基金;湖南省重点研发项目;湖南省自然科学基金面上项目;湖南省自然科学基金面上项目;湖南省自然科学基金面上项目;湖南省高新技术产业科技创新引领计划项目

在线出版日期：2022-07-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：282-288