10.13331/j.cnki.jhau.2019.06.007
马铃薯多酚氧化酶基因家族生物信息学及表达分析
通过搜索马铃薯全基因组,获得马铃薯多酚氧化酶(PPO)基因家族序列,并对其进行生物信息学及表达分析.结果显示:共获得12个马铃薯PPO基因,即StuPPO1、StuPPO2、StuPPO3、?、StuPPO12;除StuPPO9位于2号染色体外,其余11个基因串联于8号染色体的276 kb范围内;对具有3个典型结构域(Tyrosinase、PPO1_DWL、PPO1_KFDV)的基因蛋白序列进行进一步分析,结果显示StuPPO1、StuPPO2、StuPPO3、StuPPO4、StuPPO6蛋白序列相似性大于80％,且大部分StuPPO蛋白位于叶绿体;启动子顺式作用元件分析显示,StuPPO1、StuPPO2、StuPPO3、StuPPO6、StuPPO8、StuPPO9具有MeJA响应元件,StuPPO1、StuPPO3、StuPPO4、StuPPO6、StuPPO7、StuPPO8、StuPPO9具有ABA响应元件,StuPPO2、StuPPO4、StuPPO8、StuPPO9具有IAA响应元件;少数PPO基因具有对SA、GA及低温等胁迫响应相关元件;基因表达分析结果表明,不同的PPO基因其表达模式有较大的差异,StuPPO1、StuPPO2、StuPPO3在马铃薯块茎、根、匍匐茎、茎、叶柄、顶部幼叶、中部叶片、底部老叶组织中均有表达,StuPPO4仅在块茎、根、匍匐茎、茎中表达,而StuPPO6、StuPPO7、StuPPO8、StuPPO9在8个部位都没有检测到表达.此外,同一基因在不同组织中的表达也有着较大的差异.
马铃薯、PPO基因家族、生物信息学、基因表达
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S532;Q786(薯类作物)
国家公益性行业农业科研专项201503001;广东省省级科技计划项目2017A020208033,2017B020201005,2017B020232002;广东省自然科学基金项目2018A030313336;2017 年省级农业发展和农村工作专项粤财农[2017]88 号;中国农业科学院科技创新项目;作物种质创新与资源利用重点实验室省部共建国家重点实验室培育基地科学基金开放项目18KFXM03
2020-01-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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