基于高通量测序的杂交鳢转录组数据分析
运用高通量技术对杂交鳢进行转录本测序和数据分析,经拼接与组装,最终获得52065条unigenes,长度范围201～12407 bp,序列平均长度为710 bp.从长度分布、GC含量和基因表达量等方面对unigenes进行评估,数据显示测序质量较好.进一步的数据分析,共鉴定出20535个CDS,37324个SNP位点和7830个微卫星.用6大数据库Swiss-Prot、Nr、Pfam、KEGG、KOG和GO注释杂交鳢转录组unigenes,分别对应有20955、28938、19339、14052、19358和18635条unigenes获得注释.根据GO数据库的注释,可将这些unigenes分为生物过程、细胞组分和分子功能3大类共50亚类.KEGG代谢通路分析表明,这些unigenes参与了5大类30亚类共268个代谢通路,其中,参与信号转导通路的unigenes数量最多,有1716条.
杂交鳢、转录组、unigenes、基因注释
45
S917.4(水产基础科学)
国家科技支撑计划2012BAD25B04;河南省自然科学基金项目162300410069;河南省高等学校重点科研项目16A240002;广东省渔业生态环境重点实验室开放基金LFE-2016-13
2019-11-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
529-535
