基于线粒体COⅠ基因的DNA条形码在沼虾属种类鉴定中的应用
为探索DNA条形码在沼虾属(Macrobrachium)种类鉴定中的可行性,对21种沼虾(亚洲群体7种和美洲群体14种)的COⅠ基因片段序列进行分析.结果显示:沼虾COⅠ基因组成偏倚明显,AT含量(57.74％)高于GC(42.26％),GC在各个密码子位点的含量由高到低分别为第1密码子位点(49.24％)、第2密码子位点(40.72％)、第3密码子位点(36.82％);基于Kimura 2-Parameter模型分析21种沼虾的种间和种内平均遗传距离分别为0.753和0.005,种间平均遗传距离是种内遗传距离的150.6倍,符合HEBERT所推荐的鉴定不同物种的最小有效种间遗传距离为0.02以及种间遗传距离大于或等于10倍种内遗传距离的标准;在分子系统发育树中,NJ树和ML树的拓扑结构基本一致,亚洲种群和美洲种群分别以100％和82％的置信度形成2个姐妹支,并且同种沼虾都以较高的置信度聚集在同一分支内.研究结果证明,线粒体COⅠ基因能有效地对沼虾属的种类进行鉴别.
沼虾属、DNA条形码、COⅠ基因、鉴定
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S917.4(水产基础科学)
国家环保专项PM-zx097-201812-244;2019 年广东大学生科技创新培养专项pdjh2019b0510;广东省动物分子设计与精准育种重点实验室项目2019B030301010;佛山科学技术学院项目kh19051
2019-11-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
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