基于分子对接技术的拟南芥植酸酶的水解特性

摘要：

采用生物信息学、同源建模、分子对接等方法,对拟南芥植酸酶(ATMINPP)的功能结构及其与植酸的分子对接模式进行了预测.结果表明:ATMINPP由487个氨基酸组成,其二级结构由18个 α 螺旋、6个 β 折叠、伸展片段和无规则卷曲等4个主要部分构成;保守半胱氨酸在螺旋结构之间形成4个二硫键;ATMINPP蛋白有2个结构域(α/β-结构域和 α-结构域),活性位点位于2个结构域的中间;对接时,带负电的植酸结合在ATMINPP带正电的亲水性口袋内;保守序列RHGARYP中的His 66对植酸氢键所结合的磷酸基团进行亲核攻击,形成中间复合物,中间复合物水解得到磷酸和磷酸肌醇衍生物,His 343为解离基团氧原子提供质子,使得磷酸基团解离.

关键词：拟南芥植酸酶、水解、生物信息学、同源建模、分子对接、植酸

所属期刊栏目：45

分类号：Q754(分子遗传学)

资助基金：国家自然科学基金项目31671777、31871714;长沙市科技局计划项目KQ1801024

在线出版日期：2019-11-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：485-490,495