鸭MyoG基因启动子的生物信息学分析及其 甲基化频率对基因表达的影响

摘要：

采用RT–PCR技术扩增和克隆鸭MyoG基因启动子,并对其启动子序列进行生物信息学分析,采用Sequenom MassArray技术检测CpG岛在鸭肌肉组织中的甲基化水平,用qRT–PCR检测MyoG基因的表达量.结果表明,扩增得到鸭MyoG基因启动子序列2730 bp,对启动子序列预测后,发现存在2个CpG岛,其中CpG岛(–2536~–1997 bp)存在5个转录因子结合位点和多个真核生物结构元件.甲基化检测结果表明:在鸭的个体和组织水平上,启动子甲基化率均未聚类在一起;CpG位点甲基化频率存在个体差异,22%CpG位点的甲基化频率与MyoG的mRNA表达量呈负相关(P>0.05),78%CpG位点的甲基化频率呈正相关(P>0.05),其中,腿肌甲基化位点CpG_1、CpG_26.27.28.29的甲基化频率与MyoG基因表达水平均呈显著相关(P<0.05).MyoG基因在鸭与在哺乳动物中的转录调控机制存在差异.试验中发现多个影响鸭MyoG基因转录的潜在甲基化位点,其中CpG_1与CpG_26.27.28.29能通过DNA甲基化修饰影响MyoG基因在鸭腿肌中的转录.本研究结果可为鸭MyoG基因转录调控提供参考依据.

关键词：鸭、肌细胞生成素、启动子、DNA甲基化

所属期刊栏目：43

分类号：S834.2(家禽)

资助基金：国家自然科学基金项目31301964;四川省科学技术厅基金项目2015JY0110

在线出版日期：2017-05-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：187-194