水稻干尖线虫SPRYSEC基因的克隆及表达定位分析

摘要：

根据水稻干尖线虫转录组测序结果,采用cDNA末端快速扩增技术(RACE法)从水稻干尖线虫中克隆到效应因子SPRY同源基因,并将其命名为Ab-SPRYSEC(NCBI登录号为KT188820).该基因全长为2 089 bp,包含1个1 962 bp的开放阅读框(ORF).预测蛋白编码653个氨基酸,相对分子质量为72 009,理论等电点为4.82,不稳定指数为41.5,属于不稳定性蛋白.保守区预测分析结果表明,该蛋白含有B302 SPRY和CTLH 2个保守结构域,属于SPRY超家族.多序列比对分析结果表明,该基因编码蛋白与马来丝虫的SPRY(XP_001891979.1)蛋白的相似度为43％.蛋白结构分析结果表明,β-折叠与无规则卷曲是Ab-SPRYSEC蛋白的主要结构元件.表达定位分析结果表明,Ab-SPRYSEC基因的表达位置在水稻干尖线虫食道腺附近.Ab-SPRYSEC基因作为水稻干尖线虫效应因子,在水稻干尖线虫侵染宿主中发挥了重要作用.

关键词：水稻干尖线虫、SPRYSEC基因、原位杂交、cDNA末端快速扩增技术(RACE法)

所属期刊栏目：42

分类号：S435.111.4+8(病虫害及其防治)

资助基金：黑龙江省自然科学基金ZD201404;中央高校基本科研业务专项基金2572015AA09

在线出版日期：2016-06-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：305-311