辣椒多态性EST-SSR标记开发及连锁图谱构建

摘要：

采用SSR检索程序,从辣椒221 037条unigenes中筛选到17 319个SSR位点,设计了10 468对引物,并对其进行E-PCR多态性检测.结果表明,1 538对引物具有多态性,其中554条辣椒EST序列能匹配到番茄基因组上,构成了12条辣椒EST-SSR连锁群,平均每条连锁群含45.75个EST-SSR.对匹配到番茄基因组上的EST-SSR进行GO(gene ontology)分类,结果有481条EST序列被分类,其中以初生代谢、细胞代谢、生物合成过程为主,分别占34.13％、28.35％、25.82％.在KEGG map中,91条EST序列共涉及到76条代谢途径(KEGG),约67条序列参与新陈代谢途径,32条序列参与次生代谢产物合成途径.

关键词：辣椒、多态性、连锁图谱、表达序列标签技术、简单重复序列

所属期刊栏目：38

分类号：S641.3

资助基金：国家自然科学基金31101425

在线出版日期：2012-07-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：162-167