高致病性PRRSV TJ株Nsp2蛋白的缺失及其二级结构预测

摘要：

根据GenBank上发表的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV) TJ株F3代全基因序列(GenBank登录号为EU860248),结合多个PRRSV亚洲株Nsp2基因比对结果,设计合成引物,选择高致病性PRRSV TJ株噬斑克隆纯化前后14个不同代次,利用合成的引物扩增各代次Nsp基因的高变区片段及F3代和F92代Nsp2全基因,并进行产物克隆和氨基酸序列分析及结构预测.测序结果表明:PRRSV TJ株在克隆传代过程中出现了序列整段缺失,共缺失120个氨基酸,并且从F18代噬斑克隆开始一直稳定存在.缺失高变区及Nsp2蛋白二级结构预测结果表明:缺失的氨基酸使Nsp2蛋白在空间结构上发生了较大的变化,推测这可能与PRRSV TJM-F92的毒力和致病力减弱有关.

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒、非结构蛋白2、蛋白缺失、蛋白二级结构

所属期刊栏目：37

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家“十一·五”科技支撑计划项日2009BADB4B02

在线出版日期：2011-12-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：429-435