柑橘Ptcor8基因相关功能的生物信息学分析

摘要：

应用生物信息方法,对柑橘Ptcor8基因的理化性质、跨膜区域、疏水性/亲水性、二级结构、结构功能域、功能分类和同源性进行分析.结果表明:Ptcor8隶属于植物WCOR413冷诱导蛋白家族,具有1个621bp的潜在编码区,编码206个氨基酸残基;功能预测结果显示,Ptcor8编码蛋白质的相对分子质量为2.28×106,等电点为9.4,具有5个疏水区,5个跨膜螺旋,6个丝氨酸磷酸化位点;亚细胞定位和分子系统发育分析结果均表明,Ptcor8为质膜型冷诱导蛋白,Ptcor8可能为冷诱导基因,在提高植物抗寒能力方面有重要的作用.

关键词：柑橘、Ptcor8基因、生物信息学、功能分析、冷诱导

所属期刊栏目：37

分类号：Q343.1(遗传学分支学科)

资助基金：国家科技支撑计划项目2008BAD92B05-2;湖南农业大学人才科学基金09WD48

在线出版日期：2011-08-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：161-165