甘薯茎线虫乙酰胆碱酯酶基因Dd-ace-1全长cDNA的克隆和序列分析

摘要：

利用反转录聚合酶链式反应,结合快速扩增cDNA 末端(RACE)技术,克隆了甘薯茎线虫乙酰胆碱酯酶基因cDNA Dd-ace-1.该cDNA序列5′端存在反式剪接引导序列SL1,全长2 196 bp,包含1个1 908 bp的开放阅读框(GenBank登录号EF583059);在推导出的635个氨基酸残基的前体蛋白中, N 端的前24个氨基酸残基为信号肽, 随后的611个氨基酸残基是成熟的乙酰胆碱酯酶序列, 其预测的相对分子质量为70 144.12.在一级结构中, 形成催化活性中心的3个氨基酸残基 (Ser223、Glu360和His483)、胆碱结合位点Trp(106)以及在亚基内形成二硫键的6个半胱氨酸完全保守;在电鳐(Torpedo californica)乙酰胆碱酯酶分子的催化功能域中存在14个保守的芳香族氨基酸残基,其中10个在甘薯茎线虫乙酰胆碱酯酶中完全保守.该酶的氨基酸序列与南方根节线虫(Meloidogyne incognita)、胎生网尾线虫(Dictyocaulus viviparous)和秀丽小杆线虫(Caenorhabditis elegans)ACE-1的同源性为68.6%、67.2%和66.3%.与其他线虫乙酰胆碱酯酶的聚类分析显示,该乙酰胆碱酯酶(Dd-ACE-1)与其他线虫乙酰胆碱酯酶ACE-1同属一个支系.

关键词：甘薯茎线虫、乙酰胆碱酯酶、cDNA、克隆、聚类分析

所属期刊栏目：36

分类号：Q781(基因工程（遗传工程）)

资助基金：教育厅项目;湖南农业大学人才科学基金项目

在线出版日期：2010-09-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：437-441