鹰嘴豆EST资源中SSR的信息分析

摘要：

从NCBI公共数据库下载获得27 904条鹰嘴豆表达序列标签EST,去除其中低质量的和冗余序列后得到全长为6 198 092 bp的11 224 条无冗余EST.利用SSRIT(Simple sequence repeat identification tool)软件共在这些序列中发掘出982个SSR,它们分布于865条EST中,出现频率为8.69%,平均长度为15.58 bp,平均距离为6.31 kb.在鹰嘴豆EST-SSR中,二核苷酸重复是最主要的重复类型(66.90%),其次是三核苷酸重复类型(30.75%),出现最多的重复基元类型是TA/AT(24.95%).

关键词：鹰嘴豆、表达序列标签-简单重复序列、频率、特性

所属期刊栏目：36

分类号：S529.024(豆类作物)

资助基金：国家科技支撑计划;国家自然科学基金;中国博士后科学基金;高等学校学科创新引智计划计划

在线出版日期：2010-05-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：137-141