花生PDAT基因家族的全基因组生物信息学分析

摘要：

磷脂二酰甘油酰基转移酶(phospholipids:diacylglycerol acyltransferase,PDAT)催化磷脂和二酰甘油反应,生成溶血磷脂和三酰甘油,是植物三酰甘油合成的关键酶之一.为了在全基因组水平上探究花生PDA T(AhPDA T)基因家族的特征,通过生物信息学方法,结合花生基因组和转录组数据对AhPDAT家族成员从系统进化、基因结构、表达模式以及可变剪接等方面进行系统分析.结果显示,AhPDAT家族包含17个成员,不均匀分布于9条染色体上.系统进化分析发现,AhPDATs与大豆、苜蓿以及菜豆聚在一起,亲缘关系较近.基因结构分析显示,AhPDATs基因具有2～8个外显子,可编码88～742个氨基酸.表达模式分析发现,AhPDATs家族成员组织表达多样化,这种表达模式的差异表明它们功能分工的不同.同时,该家族基因还存在丰富的可变剪接类型.这些结果为今后进一步开展AhPDATs基因家族的功能研究提供参考,同时也为花生品质育种奠定了一定的理论基础.

关键词：花生、二酰甘油酰基转移酶、进化、表达模式、可变剪接

所属期刊栏目：47

分类号：S565.2;Q811.4(经济作物)

在线出版日期：2018-11-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1-7,13