一株多药耐药Comamonas kerstersii细菌的基因组分析

摘要：

从1名尿路感染患者中分离出了 1株多药耐药的Comamonas kerstersii(C.kerstersii)菌株121606,对其进行了抗微生物药敏试验(AST)和全基因组测序;然后将其与7个具有代表性的Comamonas菌株和Acidovorax菌种进行基因组比较分析,包括使用OrthoANI分析平均核苷酸同一性(ANI),以及通过snpTree网络服务器进行单核苷酸多态性(SNP)分析.最后,使用RAST服务器进行基因组序列,使用Ortho Venn软件对同源簇进行功能注释,通过CARD数据库对抗生素耐药基因(ARGs)进行预测,并利用CRISPR识别工具预测CRISPR,以及利用PHAST软件预测前噬菌体.结果表明:C.kerstersii 121606是一种多药耐药细菌,其遗传成分与其他7个Comamonas和Acidovorax菌种相似;其基因组中存在的ARGs有助于解释其多药耐药机制.这些发现为研究新型抗生素来控制多药耐药C.kerstersii感染提供了有价值的见解.

关键词：Comamonas kerstersii、多药耐药性、比较基因组分析、抗生素耐药性基因、CRISPR、前噬菌体

所属期刊栏目：45

分类号：Q939.48;R378(微生物学)

资助基金：福建省厦门南方海洋研究中心科研资金资助项目;方树福堂基金;方润华基金会资助项目

在线出版日期：2024-01-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：35-46