G／11木聚糖酶最适 pH 值的预测及其与氨基酸位置的关系

摘要：

把木聚糖酶全序列均分为 N 端，中间端（I 端）及 C 端3个部分，并分别以全序列及分段氨基酸的组成作为模型输入值．通过主成分分析（PCA）方法探讨全序列及分段氨基酸组成和最适 pH 值的相关性，运用均匀设计法分别优化支持向量机和 BP 神经网络运行参数．研究结果表明：支持向量机获得的预测模型优于神经网络，其中 RBF 支持向量机是最佳的模型．主成分分析结果显示：I 端主成分跟最适 pH 值相关性最高；相关系数 R 绝对值为0．68，得到的结果与支持向量机结果一致．

关键词：木聚糖酶、氨基酸、支持向量机、BP 神经网络、均匀设计、主成分分析

分类号：Q55(酶)

资助基金：国家自然科学基金资助项目21376103；福建省自然科学基金资助项目2013J01048

在线出版日期：2014-06-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：316-320