苏云金杆菌Ⅰ型抗癌晶体蛋白的分子模建

摘要：

通过同源建模,得到Ⅰ型抗癌晶体蛋白Parasporin-1的初始三维结构经分子动力学方法优化后,利用Ramachandran Plot检测和结构匹配等方法对模型进行评价.结果显示,结构模型中的键长、键角及二面角的分布合理,与模板蛋白的主链α碳原子的均方根差值为0.537 592, 在合理范围之内.此外,通过分析Parasporin-1结构域Ⅰ中的β-loop-β结构片段,推测出第2个蛋白酶处理激活位点的位置在两个芳香族疏水性氨基酸F167与Y168之间.

关键词：Ⅰ型抗癌晶体蛋白、同源建模、分子动力学模拟、蛋白酶、激活位点

所属期刊栏目：30

分类号：Q811.4;Q71(生物工程学(生物技术))

资助基金：国家自然科学基金资助项目40601046;细胞生物学与肿瘤细胞工程教育部重点实验室开放基金资助项目B0510011

在线出版日期：2009-10-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：420-424