吴茱萸属4种药用植物的叶绿体基因组比较与系统发育分析

摘要：

目的:明确楝叶吴萸、臭辣吴萸、吴茱萸和石虎4种药用植物叶绿体基因组特征与系统发育关系,为吴茱萸药材的分子鉴定提供依据.方法:使用CTAB法提取叶片总基因组DNA,通过Illumina NovaSeq 6000平台测序,再用SPAdes软件组装叶绿体基因组序列,利用condonW、REPuter、mVISTA等软件进行序列特征分析并构建ML系统发育树.结果:4种吴茱萸属植物叶绿体基因组为典型的四分体结构,基因组大小在158563～158762 bp之间,总GC含量为38.34%～38.37%.均注释到134个编码基因,包括89个蛋白编码基因(PCGs),37个tRNA基因和8个rRNA基因.共检测到79～98个简单重复序列(SSR)和35～41个长重复序列.叶绿体基因组比较分析表明4个物种的反向重复区(IR)边界存在差异,单拷贝区(SC)比IR区表现出更高的变异性,筛选出了trnS-trnG、ycf4-cemA和psbM-trnA等10个高多样性片段,这些片段可用于吴茱萸属物种鉴定和系统发育研究.系统发育分析结果表明,吴茱萸与石虎聚为一支,楝叶吴萸和臭辣吴萸聚为一支,且这两支互为姊妹关系.结论:本研究为芸香科植物的分类、系统发育和分子育种等研究提供了有价值的遗传信息.

关键词：吴朱萸属、芸香科、楝叶吴萸、臭辣吴萸、吴茱萸、石虎、叶绿体基因组、系统发育、物种鉴定

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分类号：R282.5(中药学)

资助基金：中医药公共卫生服务补助专项全国中药资源普查项目;中央本级重大增减支项目;湖南省中医药科研计划项目

在线出版日期：2023-07-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：44-50,65