10.3969/j.issn.1673-5412.2023.04.003
卷曲蛋白6在胰腺癌中的表达及其与免疫浸润水平相关性分析
目的 评估胰腺癌中卷曲蛋白6(FZD6)的表达及其与免疫浸润水平相关性,从而为临床决策和风险管理提供一定的科学依据.方法 利用 GEO(GSE28735、GSE15471、GSE16515 和 GSE71729)、TCGA、GTEx 和 UAL-CAN数据库分析FZD6在胰腺癌患者和健康对照者中的基因、蛋白表达水平;运用GEPIA数据库探索FZD6与患者总生存期、无病生存期的关系;利用EMTAB-6134数据中的基因表达谱进行免疫浸润分析、富集通路分析;采用MEXPRESS数据库分析DNA甲基化、拷贝数变异与FZD6表达的相关性.结果 FZD6的mRNA水平(GSE28735:t=3.532,P<0.001、GSE15471:t=6.817,P<0.001、GSE16515:t=4.166,P<0.001,GSE71729:t=2.589,P=0.012,TCGA_GTEx:t=18.118,P<0.001)和蛋白水平(t=2.160,P=0.032)在胰腺癌中的表达均高于正常组织.生存分析显示FZD6高表达的患者的总生存率(HR=1.800,P=0.005)和无病生存率(HR=2.000,P=0.003)均低于FZD6低表达的患者.免疫浸润分析揭示,FZD6与肿瘤纯度评分呈正相关(r=0.280,P<0.001),与基质评分(r=-0.220,P<0.001)、免疫评分(r=-0.280,P<0.001)和 ESTIMATE 评分(r=-0.280,P<0.001)呈负相关;FZD6高表达组具有更低的免疫评分.富集分析结果显示,FZD6相关的基因主要参与免疫应答的细胞活化、免疫反应的激活、免疫反应-调节细胞表面受体等重要免疫相关通络.DNA甲基化分析发现3个与FZD6表达呈正相关的甲基化位点,9个与FZD6表达呈负相关的甲基化位点.结论 FZD6高表达与胰腺癌患者的不良预后相关,且FZD6与肿瘤纯度正相关,而与基质分数、免疫分数、ESTIMATE分数均呈负相关,有望作为胰腺癌患者预后预测的标志物和治疗靶点.
胰腺癌、卷曲蛋白6、预后、免疫浸润
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R735.9(肿瘤学)
国家自然科学基金;国家自然科学基金
2023-08-31(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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286-292