10.3969/j.issn.1673-5412.2023.03.001
子宫内膜癌中血清反应因子家族表达特征和免疫细胞浸润的综合分析
目的 探讨转录因子血清反应因子(SRFs)家族成员在子宫内膜癌中的差异表达、生物学功能、肿瘤免疫浸润和临床预后价值.方法 以癌症基因组图谱(TCGA)数据库为基础,用R 3.6.3进行差异表达基因分析、基因集富集分析和预后分析;用Metascape进行基因本体(GO)分析;用pROC包构建受试者工作特征(ROC)曲线;用cBioPortal数据库进行基因突变、基因相关性分析;用人类基因图谱数据库进行蛋白质表达分析;用基因集变异分析包进行免疫浸润分析.结果 子宫内膜癌中肌细胞增强因子2BNB-肌细胞增强因子2B(BORCS8-MEF2B)、肌细胞增强因子2A(MEF2A)、肌细胞增强因子2C(MEF2C)、肌细胞增强因子2D(MEF2D)和SRF的表达均显著低于正常子宫内膜组织(P<0.001);SRF在Ⅰ期和Ⅲ期之间表达差异有统计学意义(P<0.05),而SRFs家族其余成员的表达在子宫内膜癌各临床分期之间差异无统计学意义(P>0.05);SRFs家族成员的表达与子宫内膜癌的总生存率、疾病特异性生存率和疾病无进展间期均无相关性(P>0.05);ROC曲线分析显示,BORCS8-MEF2B、MEF2A、MEF2C、MEF2D和SRF均具有诊断价值,曲线下面积分别为0.741、0.936、0.987、0.907和0.931;MEF2A的表达与MEF2C的表达呈正相关,MEF2D的表达与SRF的表达呈正相关,其他各SRFs家族成员之间无相关性;111个基因与SRFs家族6个基因显著密切相关;GO分析显示,这些基因与hsa03040、GO:0005681、GO:0030687、GO:0071013和GO:0008023等条目相关;这些基因相关的基因通路包括hsa03040、hsa04010、hsa04022、hsa04371、hsa04928、hsa05418等;免疫浸润分析显示SRFs家族成员与免疫细胞浸润的关系密切.结论 BORCS8-MEF2B、MEF2A、MEF2C、MEF2D和SRF表达水平的改变可能在子宫内膜癌的发生、发展中起重要作用,可能成为子宫内膜癌的诊断指标.
血清反应因子、转录因子、子宫内膜癌、免疫浸润
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R737.33(肿瘤学)
河南省医学科技攻关计划联合共建项目;河南省重点研发与推广专项科技攻关项目
2023-07-17(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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