基于网络药理学和分子对接技术探究丹参治疗重症急性胰腺炎的机制
目的 基于网络药理学和分子对接方法探究丹参对治疗重症急性胰腺炎(severe acute pancreatitis,SAP)的作用机制.方法 通过检索中药系统药理学数据库(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选出丹参的有效成分及靶点蛋白,应用Uniprot数据库将获取的靶点蛋白转换为靶基因.在OMIM、Gene Cards数据库中收集重症急性胰腺炎相关靶基因,利用Venny2.1.0分析得到药物及疾病的交集靶基因;将交集靶基因导入至STRING11.5数据库进行分析,并利用Cytoscape3.9.1软件构建蛋白相互作用网络(protein protein interaction,PPI),Network Analyzer分析丹参作用于重症急性胰腺炎的关键靶基因;通过Metascape进行富集分析,利用Cytoscape3.9.1软件构建药物成分-靶基因-通路图;借助AutoDock Tools 1.5.6、Pymol软件对药物活性成分与关键靶基因进行分子对接验证.结果 共得到丹参的有效化学成分58种、靶点蛋白133个和SAP相关基因靶基因1851个,丹参与SAP的交集靶基因有83个;丹参可能通过TP53、AKT1、ESR1、TNF、CASP3、VEGFA、IL6、MYC、ERBB2、EGFR、STAT3 等关键靶基因作用于 JAK-STAT、NF-κB、PI3K-Akt 等信号通路治疗SAP;分子对接验证显示丹参10种主要成分与关键靶基因均有较强的亲和力.结论 本研究发现丹参能够通过多种成分、多个靶点、多条信号通路的方式,发挥治疗SAP的作用,为开发及应用中药治疗SAP提供理论依据.
丹参、网络药理学、分子对接、重症急性胰腺炎、作用机制
44
R576(消化系及腹部疾病)
国家自然科学基金;河南省中医管理局国家中医临床研究基地科研专项
2023-05-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共6页
22-27
