3种基因启动子甲基化联合端粒损伤构建肺癌筛查决策树模型

摘要：

目的 探讨由外周血白细胞DNA中FHIT、RASSF1A和p16基因启动子甲基化水平以及DNA相对端粒长度4项生物标志建立的决策树模型(Decision tree,DT)在肺癌诊断中的意义.方法 通过实时甲基化特异性PCR(Real-time methylation specific PCR)法,测定200例正常对照和200例肺癌患者外周血白细胞DNA中FHIT、RASSF1A和p16基因启动子甲基化水平,实时荧光定量PCR方法测定外周血DNA相对端粒长度,基于上述4种生物标志构建肺癌诊断决策树模型.结果 肺癌组和对照组中FHIT、RASSF1A和p16基因启动子甲基化水平分别为3.33(1.86 ～6.40)和2.85(1.39 ～5.44) (P =0.002),27.62(9.09～ 52.86)和17.17 (3.86 ～ 50.87) (P=0.038),0.59(0.16 ～4.50)和0.36(0.06 ～4.00) (P =0.008),端粒相对长度分别为0.93±0.32和1.16±0.57(P＜0.001),这4项生物标志在两组间差异有统计学意义.基于4项生物标志建立的判别分析和决策树模型对预测集的的ROC曲线下面积(AUC)及95％CI分别为0.670(0.569～0.761)和0.810(0.719 ～0.882).结论 成功构建基于FHIT、RASSF1A、p16基因启动子甲基化和端粒损伤4种生物标志的肺癌诊断决策树模型.

关键词：DNA甲基化、端粒、肺癌、决策树

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分类号：R734.2(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;河南省科技攻关计划重大项目;河南省医学科技攻关计划

在线出版日期：2015-11-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

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