生物信息学筛选与子宫内膜异位症早期诊断相关的自噬差异表达基因

摘要：

[目的]探讨生物信息学筛选与子宫内膜异位症(EMT)早期诊断相关的 自噬差异表达基因(ATDEGs).[方法]使用limma包从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库获取EMT和健康对照组(healthy control,HC)的差异表达基因(DEGs),并进行GSEA富集分析.通过加权基因共表达网络分析获得与EMT相关的功能模块,并对功能模块中的基因进行功能(GO)和通路(KEGG)富集分析.从Genecards数据库下载了 ATDEGs.三部分取交集获取与EMT相关的ATDEGs,并构建了蛋白互作网络图;采用LASSO算法筛选出诊断基因,并通过受试者工作特征(ROC)曲线评估这些基因的诊断能力.[结果]本研究共计获得了 62个ATDEGs,并采用Cytoscape的MCODE插件找到了一个最显著的模块,其中包括17个枢纽基因;LASSO分析筛选出7个诊断基因,这些基因在外部数据集中得到了验证,提示其具有较好的诊断能力.[结论]本研究结果有助于EMT的早期诊断和干预,并为进一步的临床工作和机制研究提供了理论基础.

关键词：子宫内膜异位症/诊断、子宫内膜异位症/病因学、自噬/遗传学、基因

所属期刊栏目：40

分类号：R711.71(妇产科学)

在线出版日期：2023-09-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1006-1010