10.13515/j.cnki.hnjpm.1006-8414.2023.01.010
2020-2021年河南省漯河市严重急性呼吸道感染病例呼吸道合胞病毒基因特征分析
目的 了解2020-2021年河南省漯河市严重急性呼吸道感染(SARI)病例中的人呼吸道合胞病毒(HRSV)基因特征.方法 采集2020年4月至2021年3月漯河市中心医院因SARI住院的病例标本,用荧光定量PCR法进行HRSV病毒核酸检测,对检测阳性标本使用RT-PCR法进行HRSV G基因第二高变区扩增,使用CExpress以及MEGA 7.0软件进行序列编辑、进化树构建和基因特征分析.结果 共采集SARI咽拭子标本170份,其中HRSV核酸检测阳性标本15份(8.8%).对阳性标本进行靶基因扩增后获得12条序列,经分析全部为HRSVB亚型的BA9基因型.8条序列与来自欧洲的BA9基因型序列汇成一簇,处于进化树顶端;4条序列与来自国内和澳洲的BA9基因型序列汇成一簇.与参考株相比,12条序列在重复插入的60个碱基区及aa164-176区域出现突变,同时存在253NITT糖基化位点的增加和276 NSTQ糖基化位点的缺失.结论 HRSV B亚型是2020-2021年河南省漯河市SARI病例中流行的亚型,BA9基因型为流行基因型,与流行株相比变异较大,应对BA9基因型HRSV进行持续深入的监测,为科学防控SARI提供依据.
人呼吸道合胞病毒、严重急性呼吸道感染、G蛋白、基因特征
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R51(传染病)
河南省医学科技攻关计划联合共建项目LHGJ20190692
2023-04-20(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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