2019-2020年深圳市大鹏新区柯萨奇病毒A6型流行及其VP1基因特征分析

摘要：

目的 了解2019-2020年深圳市大鹏新区手足口病(hand-foot-mouthdisease,HFMD)病例中柯萨奇病毒A6型(CVA6)流行情况及VP1区基因特征,为HFMD的预防和控制提供科学依据.方法 收集临床诊断为HFMD病人的肛拭样本,采用实时荧光RT-PCR方法检测病毒核酸,以RT-PCR法扩增CVA6VP1全长基因并测序,利用生物信息软件在分子水平分析毒株的进化特征.结果 在检出的156份肠道病毒阳性样本中,CVA16、CVA6、CVA10阳性率分别为4.49％、83.33％、3.21％,8.97％未能分型.其中15株CVA6分离毒株核苷酸和氨基酸序列同源性分别为91.85％～99.86％和85.81％～100.00％.系统进化树显示,15株CVA6位于同一分支,均属于D基因型中的D3基因亚型,与2018年黑龙江分离株MN845847、长春分离株MN845816、2015年上海分离株KX064297和2017年广东分离株MN845823进化关系较近,而与CVA6原型株Gdula进化距离较远.结论 2019-2020年深圳市大鹏新区HFMD病原CVA6型为绝对优势流行毒株,应加强对非EV71型、非CVA16型等其它肠道病毒监测.

关键词：手足口病、CVA6、序列分析、VP1基因、进化分析

所属期刊栏目：33

分类号：R512.5(传染病)

资助基金：深圳市大鹏新区科技创新和产业发展专项资金资助项目YL202001-02

在线出版日期：2022-08-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：496-498,502