河南省4株新型冠状病毒的分离和病原特征分析

摘要：

目的 分离新型冠状病毒毒株,分析新型冠状病毒基本生物学特征和遗传进化特征.方法 筛选具有代表性的新型冠状病毒核酸阳性样本,采用Vero和Vero-E6细胞系分离病毒、荧光定量RT-PCR方法初步鉴定,MiSeq测序技术获取新型冠状病毒全基因组序列,开展进化分析.结果 4个新型冠状病毒核酸阳性的咽拭子样本在Vero和Vero E6细胞均产生细胞病变,细胞病变可以稳定传代.荧光定量RT-PCR鉴定四株病毒二代培养物均显示为新型冠状病毒核酸阳性;三株病毒二代培养物经Miseq测序获得新型冠状病毒全基因组序列,一株病毒二代培养物获得部分新型冠状病毒基因组序列.全基因序列比较显示三株新型冠状病毒均与武汉分离株Wuhan-Hu-1和WIV04亲缘关系最为接近,HN01与Wuhan-Hu-1株的NS3蛋白存在一个氨基酸差异,HN02与Wuhan-Hu-1株的NS8蛋白存在一个氨基酸差异,HN04与Wuhan-Hu-1株在同源编码区核苷酸同源性为100％.结论 河南省新型冠状病毒株与湖北武汉株高度同源,暂未发现有意义的新型冠状病毒变异株.

关键词：严重急性呼吸综合征冠状病毒2型、新型冠状病毒肺炎、全基因测序、进化分析

所属期刊栏目：31

分类号：R446(诊断学)

资助基金：2020年新型冠状病毒防控应急攻关项目201100310800

在线出版日期：2020-12-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：801-804