基于转录组信息的黑果枸杞WD40蛋白质家族分析

摘要：

WD40蛋白质为真核生物中一种常见蛋白质,广泛参与植物生长发育的多种生物过程,在蛋白质-蛋白质及蛋白质-DNA的相互作用中发挥重要作用.为系统分析黑果枸杞WD40蛋白质家族成员,本研究以黑果枸杞青色期、转色期和成熟期3个发育时期的果实转录组测序数据为基础,结合Nr、Nt、Pfam、KOG/COG、Swiss-prot、KEGG及G0 7个数据库和NCBI网站,对黑果枸杞WD40蛋白质编码基因进行筛选注释.结果 表明,共得到77个黑果枸杞WD40蛋白质家族成员,黑果枸杞WD40蛋白质结构域组成多样,且在不同物种间高度保守;亚细胞定位预测分析表明,黑果枸杞WD40蛋白质家族成员多位于细胞核及细胞质中;黑果枸杞和拟南芥WD40蛋白质共建的系统进化树可分为五个亚家族;WD40蛋白质家族成员编码基因随果实发育的表达模式表明,黑果枸杞WD40蛋白质家族成员可能参与了其果实花青素的变化调控.本研究结果为枸杞WD40蛋白质的分离及功能研究奠定了一定的理论基础.

关键词：黑果枸杞、转录组测序、WD40蛋白、分层聚类分析、表达模式

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资助基金：国家自然科学基金31701878、31660045;国际合作专项项目2015DFA90900;宁夏林业科技重大公益枸杞专项2016-328

在线出版日期：2019-05-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：482-489