甘薯二倍体近缘野生种三裂叶薯MYB转录因子全基因组分析及逆境胁迫响应

摘要：

MYB是真核生物中一类重要的转录因子,参与调控植物生长发育、初生次生代谢和生物或非生物胁迫响应.为全面解析甘薯基因组MYB转录因子信息,本研究基于甘薯二倍体近缘野生种三裂叶薯的全基因组测序数据,利用多种生物学软件和在线工具对三裂叶薯MYB转录因子的结构域、基因结构、保守基序、染色体定位和系统进化等进行鉴定和分析.利用qRT-PCR检测其中10个R2R3-MYB基因在干旱和盐胁迫下的表达情况.结果表明,在三裂叶薯的全基因组中共鉴定出不均匀分布于15条染色体的160个ItbMYB基因,其中第7号染色体上分布最多(21个基因),第8号染色体上分布最少(6个基因).根据MYB结构域所含MYB重复个数,1 60个ItbMYB家族转录因子被分为4类,其中1R类包含36个基因、R2R3类120个基因、3R类4个基因、4R类1个基因.系统进化分析显示,1 60个ItbMYB聚为18个亚家族,且同一亚家族的ItbMYB转录因子的motif类型和数目相似,但所含外显子和内含子的数目不同.根据拟南芥R2R3-MYB转录因子的分类标准,进一步将三裂叶薯R2R3-MYB类分为30个亚类.qRT-PCR检测结果表明,R2R3-MYB响应干旱和盐胁迫,且不同胁迫时间下不同组织中的表达量存在差异.本试验为进一步研究甘薯MYB转录因子的功能奠定了一定的理论基础.

关键词：三裂叶薯、MYB转录因子、基因组鉴定、逆境胁迫、表达分析

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资助基金：山西省人才引进与开发专项614191;山西省农业科技成果转化和推广示范项目2018-5;2018年山西农业大学科技创新基金,山西省煤基重点科技攻关项目FT-2014-01

在线出版日期：2018-07-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：1338-1348