大麦白化颖壳突变体的转录组学分析

摘要：

为了探究大麦白化颖壳突变体形成机理,以白化颖壳突变体(AL)和野生型植株(WT)为试验材料,对2份材料抽穗期的颖壳进行转录组测序分析,通过Illumina HiSeqTM2500高通量转录组测序技术分别从WT和AL中获得2.7 Gb和4.1 Gb有效数据,拼接组装后得到64 634条通用基因(unigenes),其中长度大于1 kb的有23 696条.通过对2份材料间差异基因的筛选,共得到672个差异表达基因(DEGs),其中139个上调表达,533个下调表达.GO功能富集分析发现,在分子功能类型中注释的差异基因主要与叶绿体相关;KEGG显著富集分析发现差异基因广泛涉及碳代谢、光合作用等调控途径.对其中6个相关基因进行了RT-qPCR验证,表达趋势与RNA-Seq测序结果一致.表明AL的形成可能是由于叶绿体形成和发育相关基因的表达受到抑制,进一步导致了光合作用的下降,该研究结果对深入探究大麦的白化形成机理具有重要的参考价值.

关键词：大麦、白化颖壳突变体、转录组测序、差异基因

所属期刊栏目：31

分类号：S51;R3

资助基金：江苏省自主创新资金[CX142125],江苏省海洋滩涂生物化学与生物技术重点建设实验室开放性课题K2016-03;盐城市科技创新专项资金YK2016009

在线出版日期：2018-02-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：2332-2339