番茄KNOX基因家族鉴定及茄科作物KNOX基因进化关系分析

摘要：

为了探明番茄KNOX基因家族特征及茄科作物中KNOX的进化关系,利用生物信息学方法,在全基因组水平上对番茄及其它茄科作物KNOX基因家族成员进行鉴定和分析.结果表明,番茄基因组中共含有8个KNOX基因(SlKNOX1～SlKNOX8),分别分布在番茄8条染色体上;多序列比对发现,除SlKNOX5外,所有基因均含有同源异型盒蛋白特有的4种结构域,即KNOX1、KNOX2、ELK和Homeobox KN.利用系统发育树将茄科作物KNOX基因分为2类:Class Ⅰ和ClassⅡ.茄科作物KNOX基因与拟南芥同源基因可能经历了不同的进化历程,在茄科作物中,特有的进化分支(Class Ⅰ C)已经出现.qRT-PCR分析发现,番茄SlKNOX1在花蕾和花中具有较高表达,在果实生长发育过程中表达量逐渐降低,SlKNOX2～ SlKNOX4在果实生长发育过程中几乎不表达,SlKNOX6和SlKNOX7在所测组织中均有表达,SlKNOX8在果实成熟过程中表达量逐渐增加,且在根中表达量最大.本研究在全基因组水平上揭示了番茄中KNOX基因家族特征以及茄科作物中KNOX基因的系统发育关系,为进一步揭示KNOX基因家族在番茄组织器官中的功能及进化模式奠定了基础.

关键词：番茄、KNOX基因家族、基因结构、表达分析、进化

所属期刊栏目：31

分类号：S43;S85

资助基金：浙江省农业新品种选育重大科技专项2012C12903-1-5

在线出版日期：2017-06-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1263-1271