甜高粱SUT1基因克隆、表达及生物信息学分析

摘要：

为获知甜高粱蔗糖转运蛋白基因SUT1及其功能,采用同源克隆方法结合RACE技术克隆甜高粱SUT1基因,并对其进行生物信息学分析.克隆得到甜高粱蔗糖转运蛋白基因SUT1 cDNA全长为2 472bp,包括1 560bp编码区序列,编码含有519个氨基酸的蛋白.该蛋白是1个疏水性膜蛋白,分子量约为55kDa,理论等电点pI为8.86;无信号肽剪切位点,含有12个明显的跨膜螺旋拓扑结构,预测含有6个丝氨酸激酶磷酸化位点、4个苏氨酸激酶磷酸化位点和2个酪氨酸激酶磷酸化位点;包含1段低复杂度序列和12个保守的跨膜螺旋结构域.在亚细胞水平,SUT1主要定位于叶绿体类囊体膜、质膜、高尔基体及内质网膜上;二级结构主要以α-螺旋为主,其中α-螺旋占43.35％,无规则卷曲占34.68％,延伸链占19.08％,β-转角占2.89％;预测SUT1蛋白主要在运载结合中发挥重要作用.SUT1基因表达分析结果表明,SUT1基因在各组织中均有表达,叶中表达量最高,其次分别为叶鞘、茎和根,穗中表达量最低.SUT1基因的克隆及其结构、性质与功能的初步分析,可为研究该基因在甜高粱源库互作关系中的功能机制奠定基础.

关键词：甜高粱、蔗糖转运蛋白、SUT1基因、表达、生物信息学分析

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资助基金：国家自然科学青年基金项目31101194,国家杂粮工程技术研究中心建设项目2011FU125X07,黑龙江农垦总局科技攻关项目

在线出版日期：2016-03-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：2276-2286